تعد وحدة الرسائل والأطاريح من الوحدات المهمة في المكتبة المركزية إذ تقدم تسهيلات كبيرة للباحثين من طلبة الدراسات العليا، وتضم هذه الوحدة الرسائل الجامعية والأطاريح باللغتين العربية والاجنبية الممنوحة للطلبة من داخل القطر وخارجه، وتكون مرتبة على الرفوف حسب نظام ديوي العشري.
ومن جانبة تحدث الاستاذ علي عبد علي عوفي مسؤول وحدة الأطاريح أن هذه الوحدة تضم (14963)الف أطروحة ورسالة عربية واجنبية في كافة التخصصات الانسانية والعلمية ،إذ يتكون كادر الوحدة من ثلاثة موظفين كل حسب تخصصه يعملون على تقديم الخدمات للمستفيدين من طلبة الدراسات العليا وطلبة المراحل الاولية،وإعارتهم الأطروحة أو الرسالة الجامعية لمدة ثلاثة أيام فقط وحسب سياق عمل خاص بالوحدة ويشمل تسجيل أسم الطالب وأسم كلية في السجل الخاص بالأعارة وحسب رقم الهوية الخاصة بالمكتبة المركزية مع تحديد موعد استرجاع الأطروحة أو الرسالة الجامعية.
ومن ضمن عمل هذا الكادر تسجيل الأطاريح الجديدة التي تصل للوحدة في سجلات وتضاف الى السابقة ، وعمل بطاقات فهرسة للأطاريح الجديدة وتنزيلها في جرارات حسب رقم التصنيف للأطروحة أوالرسالة الجامعية بالأضافة الى عمل تكعيب للأطاريح الجديدة والقديمة لتسهيل عملية البحث عنها من قبل الموظف المختص ،ومساعدة المستفيدين للوصول الى المعلومات التي يحتاجونها في دراستهم الجامعية مع ترتيب الأطاريح الجديدة والقديمة على الرفوف اثناء استلامها من الطلبة .علما أن هذه الوحدة يكون العمل فيها من الساعة الثامنة والنصف صباحا لغاية الثانية بعد الظهر وعلى مدى ايام الاسبوع.
ولايفوتنا الذكر بعدد الإحصاءات الاسبوعية والشهرية التي تتضمن عدد رواد الوحدة وعدد الأطاريح المعارة ونوعية المستعيرين سواء أكانوا تدريسين أو طلبة دراسات عليا أو طلبة دراسات أولية ،